Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms