Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc63Q8CDV6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms