Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc38Q8CDN8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc38Q8CDN8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc38Q8CDN8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc38Q8CDN8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc38Q8CDN8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc38Q8CDN8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc38Q8CDN8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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