Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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