Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fbxo48Q8CAT8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms