Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lin9Q8C735 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lin9Q8C735 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms