Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms