Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc113Q8C5T8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms