Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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NcaphQ8C156 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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NcaphQ8C156 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NcaphQ8C156 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NcaphQ8C156 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NcaphQ8C156 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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