Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Nek11Q8C0Q4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nek11Q8C0Q4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nek11Q8C0Q4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nek11Q8C0Q4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nek11Q8C0Q4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nek11Q8C0Q4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek11Q8C0Q4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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