Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx16Q8C080 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx16Q8C080 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx16Q8C080 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Snx16Q8C080 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Snx16Q8C080 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Snx16Q8C080 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx16Q8C080 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Snx16Q8C080 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms