Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms