Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Triml1Q8BVP1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms