Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pggt1bQ8BUY9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pggt1bQ8BUY9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms