Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep55Q8BT07 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cep55Q8BT07 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms