Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ap3s2Q8BSZ2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms