Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tspan12Q8BKT6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms