Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca8Q8BHX3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms