Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q8BGC1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BGC1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms