Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf187Q8BFX1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf187Q8BFX1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf187Q8BFX1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf187Q8BFX1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf187Q8BFX1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf187Q8BFX1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf187Q8BFX1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf187Q8BFX1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf187Q8BFX1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf187Q8BFX1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf187Q8BFX1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf187Q8BFX1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf187Q8BFX1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf187Q8BFX1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf187Q8BFX1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf187Q8BFX1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf187Q8BFX1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf187Q8BFX1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf187Q8BFX1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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