Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ttc28Q80XJ3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ttc28Q80XJ3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ttc28Q80XJ3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ttc28Q80XJ3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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