Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ckap2lQ7TS74 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms