Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Scn4bQ7M729 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scn4bQ7M729 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms