Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ScocQ78YZ6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms