Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Atp8b3Q6UQ17 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b3Q6UQ17 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms