Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx13Q6PHS6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms