Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms