Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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