Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
BC061212Q6P8K3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms