Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PrimpolQ6P1E7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrimpolQ6P1E7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms