Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NipblQ6KCD5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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