Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpm4Q6IRU2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpm4Q6IRU2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms