Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nop58Q6DFW4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop58Q6DFW4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms