Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Pdzrn3Q69ZS0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Pdzrn3Q69ZS0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Pdzrn3Q69ZS0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Pdzrn3Q69ZS0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Pdzrn3Q69ZS0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Pdzrn3Q69ZS0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Pdzrn3Q69ZS0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzrn3Q69ZS0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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