Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PnkdQ69ZP3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PnkdQ69ZP3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PnkdQ69ZP3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms