Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna3Q65CL1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms