Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa17Q64016 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms