Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms