Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SspnQ62147 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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SspnQ62147 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SspnQ62147 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SspnQ62147 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SspnQ62147 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SspnQ62147 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SspnQ62147 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SspnQ62147 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SspnQ62147 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SspnQ62147 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SspnQ62147 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SspnQ62147 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SspnQ62147 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SspnQ62147 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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