Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tfap2bQ61313 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tfap2bQ61313 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms