Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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JrkQ60976 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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JrkQ60976 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
JrkQ60976 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms