Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Slc6a4Q60857 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Slc6a4Q60857 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Slc6a4Q60857 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Slc6a4Q60857 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Slc6a4Q60857 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Slc6a4Q60857 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Slc6a4Q60857 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Slc6a4Q60857 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Slc6a4Q60857 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Slc6a4Q60857 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Slc6a4Q60857 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc6a4Q60857 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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