Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mkrn3Q60764 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mkrn3Q60764 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mkrn3Q60764 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mkrn3Q60764 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Mkrn3Q60764 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mkrn3Q60764 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Mkrn3Q60764 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mkrn3Q60764 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Mkrn3Q60764 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms