Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprnQ60673 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprnQ60673 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms