Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf12Q5SPL2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Phf12Q5SPL2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms