Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms