Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms