Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rtl5Q5DTT4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rtl5Q5DTT4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms