Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdv3Q4VAA2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cdv3Q4VAA2 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms