Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm527Q4KL13 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms